Analiza bioinformatica - HiSeq, subtipuri tumorale

Servicii de analiza bioinformatica a datelor de secventiere Illumina HiSeq obtinute din experimente de laborator si interpretarea rezultatelor. Analiza bioinformatica va porni de la rezultatele analizei primare (obtinute deja prin pachetele software standard oferite de Illumina, ex: TopHat/Cufflink) si va include: 1) interpretarea calitatii datelor (quality control) din analiza primara, 2) o analiza comparativa intre rezultatele obtinute pe mai multe sub tipuri de celule/tumori (analiza valabila pana la 3 sub tipuri). In acest sens, listele de expresie genica diferentiala intre probele tumorale vs probe control, pentru fiecare dintre subtipurile de tumori, vor fi analizate pentru a obtine: a) informatii despre procesele biologice potentate/atenuate (enriched) in fiecare subtip de tumora; b) informatii despre caile de semnalizare potentate/atenuate (enriched) in functie subtip de tumora; c) o lista a genelor care sunt over-expressed/under-expressed in toate cele subtipurile de tumori; d) liste de gene cu potential de a fi biomarker diferential intre subtipurile de tumori. Ca rezultat al acestei analize, Chronos Biosystems va livra un raport de evaluare a rezultatelor