Sari la conținut

← Institutul Clinic Fundeni

Analiza bioinformatica - HiSeq, subtipuri tumorale

DA21425177 · publicată 09.10.2018 · finalizată 12.10.2018 · de la Chronos Biosystems (Bucuresti)

13 mii leivaloare atribuită
—valoare estimată
72316000-3cod CPV
Cantitatea nu e publicată în datele deschise. Exportul MS/SEAP are doar denumirea și valoarea; cantitatea și prețul unitar apar doar în fișa SICAP a achiziției, pe care o poți consulta pe e-licitatie.ro.

Descrierea din SEAP

Servicii de analiza bioinformatica a datelor de secventiere Illumina HiSeq obtinute din experimente de laborator si interpretarea rezultatelor. Analiza bioinformatica va porni de la rezultatele analizei primare (obtinute deja prin pachetele software standard oferite de Illumina, ex: TopHat/Cufflink) si va include: 1) interpretarea calitatii datelor (quality control) din analiza primara, 2) o analiza comparativa intre rezultatele obtinute pe mai multe sub tipuri de celule/tumori (analiza valabila pana la 3 sub tipuri). In acest sens, listele de expresie genica diferentiala intre probele tumorale vs probe control, pentru fiecare dintre subtipurile de tumori, vor fi analizate pentru a obtine: a) informatii despre procesele biologice potentate/atenuate (enriched) in fiecare subtip de tumora; b) informatii despre caile de semnalizare potentate/atenuate (enriched) in functie subtip de tumora; c) o lista a genelor care sunt over-expressed/under-expressed in toate cele subtipurile de tumori; d) liste de gene cu potential de a fi biomarker diferential intre subtipurile de tumori. Ca rezultat al acestei analize, Chronos Biosystems va livra un raport de evaluare a rezultatelor
// ~8,8 mil. de fișe aproape identice: rămân deschise și urmărite, dar în index intră paginile care le adună // (spital, furnizor, CPV, top) — altfel Google le vede ca pagini subțiri și consumă bugetul de crawl pe ele (decizia lui Alex, 24.09).